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为了鉴定乳腺癌细胞系,我们的科学家发现了两个标记物。。

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近日,记者从西安交通大学获悉,生命学院生命分析化学与仪器研究所赵永喜教授团队首次证实,5hmu和5hmc可作为鉴别正常、致癌和高转移乳腺细胞系的标志物。其相关结果发表在国际著名化学期刊《美国化学学会期刊》上,基于对编码微凝胶的单细胞5hmU/5hmC的可视化分析。核酸表观遗传学是在碱基序列不变的情况下,引起基因功能改变的遗传机制。其中,5-羟甲基胞嘧啶(5hmc)作为哺乳动物DNA的“第六碱基”受到广泛关注。

作为另一种羟甲基嘧啶,5-羟甲基尿嘧啶(5hmu)可以通过5-hmc脱氨或胸腺嘧啶氧化产生,在细胞中起重要作用。但5hmu的化学结构与5hmc相似,其细胞丰度小于后者的1%。因此,很难对它们进行识别和区分,特别是在单细胞水平上分析和探索它们的细胞功能。西安交通大学教授赵永喜从事高通量单分子单细胞分析、核酸化学与生物学、功能性纳米材料和分子探针等研究。在西安交通大学生物医学信息工程重点实验室资源库的基础上,在上海交通大学范春海院士的支持下,他们开发了一种能区分5hmU和5hmC的化学酶(化学酶)标记方法,构建了单细胞凝胶液滴微流控DNA扩增检测系统,实现了单细胞5hmU/5hmC的单分子可视化分析。

利用深度学习算法,首次证实5hmu和5hmc可以作为乳腺癌细胞系正常、癌变和高转移的标志物。记者石俊斌通讯员刘玉涵。。

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